Mots-Clés

NGS Chipseq RNAseq HiC, Language R

Description

L'ingénieur(e) sera affecté(e) dans l'équipe Transcription et Epigénomique dans les Cellules T (6 membres) et travaillera avec le Dr Cyril Esnault sur un projet financé par l’ANR. Notre équipe dirigé par Jean-Christophe Andrau travaille dans un contexte international (anglais) et interdisciplinaire (biologie, bioinformatique, génomique, biophysique). L'Institut de Génétique Moléculaire de Montpellier est une unité mixte de recherche CNRS et Université de Montpellier, de 180 personnes reparties en 13 groupes de recherche, 9 services communs (dont 5 mutualisés avec d'autres unité du campus CNRS) et 9 plateformes technologiques et scientifiques. L'IGMM est un institut multidisciplinaire dont les travaux ont un impact international fondamental et appliqué en biologie moléculaire et cellulaire (www.igmm.cnrs.fr). Informations: https://www.igmm.cnrs.fr/team/transcription-epigenomique-dans-les-cellules-t/

Missions

L'ingénieur(e) aura en charge :

- l’analyse d’expériences de génomique fonctionnelle (HiC, RNA-seq, ATAC-seq,..).

- Participation à la mise au point d’outils bioinformatiques.

- Support analytique aux différents projets de l'équipe.

Activités

- Contrôle qualité de données de séquençage à haut débit.

- Utilisation des packages d’alignement de données de séquençage à haut débit.

- Utilisation des packages de visualisation de données de séquençage à haut débit.

- Analyses différentielles.

- Présentations à l’équipe de l’avancée des travaux.

- Participation au montage de figures scientifiques.

Compétences

- Organisation et rigueur dans le travail.

- Anglais scientifique de base.

- Connaissances en génomique et en bioinformatique (langages : R, Python principalement).

- Connaissances en biologie moléculaire utiles pour le poste.

Informations générales :

Expérience souhaitée : 0-3 ans.

Pour postuler: Merci d’adresser vos CV, lettre de motivation et références sur le portail CNRS : https://emploi.cnrs.fr/Offres/CDD/UMR5535-SARADE-003/Default.aspx

Pour plus d’informations contacter : cyril.esnault@igmm.cnrs.fr