Bioinformatics engineer (multiple positions)

 CDD · Ingénieur autre  · 18 mois    Bac+5 / Master   Institut du Cerveau - ICM - Data and Analysis Core · Paris (France)

Mots-Clés

Bioinformatique Analyse Neuroscience Recherche Biostatistique

Description

Ingénieur(e) en bio-informatique (H/F) (plusieurs postes disponibles)

Poste à pourvoir : Dès que possible Type de contrat : 

Type de contrat : Contrat à durée déterminée 18 moisD


La plateforme Data and Analysis Core donne accès à des solutions logicielles et à une expertise méthodologique pour une variété de processus de gestion et d'analyse de données biomédicales, répartis en trois domaines : 

  • Gestion de données
  • Analyse des données génomiques
  • Biostatistique, intégration de donnée et IA

Afin de renforcer l'activité "Analyses des données génomiques", la plateforme Data and Analysis Core recrute plusieurs ingénieurs en bioinformatique.

Missions principales : 

Vous participerez à l’analyse et à l’interprétation des données omiques neuro focalisées.

Votre travail consistera à :

  • Assurer l’analyse bio-informatique des données issues des technologies NGS
  • Développer et mettre en place des nouveaux pipelines pour l’analyse bio-informatique
  • Assurer une veille scientifique et technique (rechercher des nouvelles méthodes/logiciels pur l’analyse de données de séquençage à haut débit)
  • Fournir une expertise et des conseils méthodologiques aux équipes de recherche 
  • Accompagner les équipes et les projets de recherche dans la mise en place des plans d’analyse et le traitement des données biologiques et médicales 
  • Participer à des missions de formation en bio-informatique destinés aux biologistes, cliniciens et médecins.

Profil :

  • Expérience professionnelle souhaitée d’au moins un an dans l'analyse de données de séquençage
  • Diplômes : Bac+5 (master ou ingénieur) en bio-informatique, ou niveau équivalent en biologie/informatique complété par une expérience professionnelle dans l’autre domaine

Savoir Faire :

  • Expertise en analyse de données génomiques
  • Maîtrise des environnements UNIX/Linux (shell)
  • Maîtrise de la programmation (notamment des langages de script et R)
  • Bonnes connaissances des outils standards de bio-informatique pour l’analyse et l’interprétation des données de séquençage haut-débit (DNA, RNAseq, Single-Cell RNAseq)
  • Pratique experte d’au moins une méthode d’analyse des données NGS
  • Autonomie pour apprendre rapidement des nouvelles méthodes adaptées à la grande variété des données
  • Des compétences dans les domaines suivants serait un plus: versionnage du code avec GIT, utilisation de cluster de calcul (SLURM), utilisation de gestionnaire de workflow type Snakemake

Savoir-être :

  • Bonne maîtrise de l’anglais scientifique 
  • Capacité d’intégration au sein d’une équipe multidisciplinaire
  • Capacité de communication avec des chercheurs venant d’horizons scientifiques variés 
  • Motivation pour les projets complexes et pour faire avancer la recherche en Neurosciences 

Contact : 

Merci d'envoyer votre CV et votre lettre de motivation à :

  • recrutement@icm-institute.org
  • justine.guegan@icm-institute.org

Candidature

Procédure : Merci d'envoyer votre CV et votre lettre de motivation à : recrutement@icm-institute.org justine.guegan@icm-institute.org

Date limite : None

Contacts

Justine Guégan

 juNOSPAMstine.guegan@icm-institute.org

 https://institutducerveau-icm.org/fr/annonce/ingenieure-bio-informatique-h-f/

Offre publiée le 27 avril 2021, affichage jusqu'au 31 juillet 2021