Ingénieur(e) statisticien ou bioinformaticien ou agronome

 CDD · IE  · 6 mois    Bac+5 / Master   INRAE · Saint-Gilles (France)  Minimum 2 033€ brut mensuel selon expérience professionnelle

 Date de prise de poste : 1 février 2022

Mots-Clés

optimisation de paramètres évaluation d'un modèle de simulation prairie stockage de carbone

Description

Le recrutement a pour objet la finalisation du travail de calibration de la prairie et d’évaluation de la qualité de simulation de la dynamique du carbone organique des sols sous prairies temporaires et permanentes par le modèle STICS (https://www6.paca.inra.fr/stics/). Il s’inscrit dans le cadre du projet CarSolEl (2018 - 2022) financé par l’ADEME et qui vise à fournir des valeurs de référence sur les niveaux de stockage/déstockage du carbone dans les sols des systèmes de cultures majoritairement présents dans trois territoires d’élevage contrastés en France. Ces références sont établies sur la base de l’évaluation/amélioration puis de l’utilisation de plusieurs modèles de simulation. Elles doivent permettre d’améliorer la fiabilité des préconisations apportés par les outils de conseil actuellement déployés dans les territoires ruraux français afin d’accompagner les changements de pratiques ou de systèmes d’exploitation agricole pour une moindre contribution au changement climatique.
Parmi les modèles utilisés dans le projet, le modèle STICS, développé depuis 20 ans, bénéficie d’une grande communauté d’utilisateurs et d’experts scientifiques, ce qui le place comme l’un des modèles sol-plante les plus utilisés en recherche en France. Ce modèle simule de façon générique le fonctionnement des cultures et des prairies en rotation, en réponse au pédoclimat et aux pratiques. Des développements ont été apportés à ce modèle qui permettent de mieux représenter les racines et leurs différentes fonctions, ainsi que les processus liés à la dynamique de la matière organique des sols. Dans le cadre du projet CarSolEl, plusieurs optimisations de paramètres impliqués dans la simulation des racines des prairies ont déjà été réalisées en utilisant les données d’un essai long-terme. Les calibrations obtenues ont été évaluées sur deux autres essais de long terme et se révèlent prometteuses pour améliorer la simulation de la dynamique du carbone organique des sols sous prairie. Toutefois, ce travail demande à être poursuivi afin :
- d’intégrer de nouvelles mesures du carbone organique des sols qui permettront de mieux décider de la meilleure optimisation à retenir ;
- de relancer les optimisations des paramètres impliqués dans la simulation des racines de prairie ;
- d’évaluer le paramétrage retenu sur la base de données utilisée en routine pour l’évaluation de STICS, avant sa diffusion plus large à l’ensemble de la communauté des utilisateurs de STICS.
Dans ce cadre, le candidat recruté s’appuiera sur le travail de calibration et d’évaluation de STICS, déjà en grande partie formalisé et le complétera au besoin. Il utilisera pour cela les outils déjà existants de calibration des paramètres et d’évaluation du modèle (https://github.com/SticsRPacks), et s’appuiera sur
les jeux de données de plusieurs essais long-terme déjà mis en forme et simulés, dont deux appartiennent au SOERE ACBB (https://www.soere-acbb.com/). La mise en oeuvre des calculs, déjà formalisée, utilisera la plateforme de calcul meso@LR (https://meso-lr.umontpellier.fr/). En amont, le candidat aura en charge d’ajouter de nouvelles données expérimentales à la base de données utilisée pour l’optimisation des paramètres. Un travail de mise en forme des données d’entrée correspondant à la dernière version du modèle sera également à réaliser. En l’absence de formation à l’utilisation du modèle et des outils associés, le candidat sera formé au début de son recrutement.

Candidature

Procédure : Transmettre une lettre de motivation et un CV, les coordonnées de votre dernier encadrant (stage, ou CDD)

Date limite : 31 janvier 2022

Contacts

Anne-Isabelle Graux

 anNOSPAMne-isabelle.graux@inrae.fr

Offre publiée le 16 décembre 2021, affichage jusqu'au 31 janvier 2022