Mots-Clés

Bioinformatique

Description

Le Cirad recrute un.e Ingénieur.e en bioinformatique au sein de l'UMR AGAP institut « Amélioration Génétique et adaptation des plantes méditerranées et tropicales ». Vous serez accueilli.e au sein du plateau de bioinformatique et aurez des interactions privilégiées avec l'équipe Développement Adaptatif du Riz et du Sorgho (DARS) de l'UMR AGAP Institut.
 

Formation et expérience demandées :
Diplôme de type master 2 ou école d'ingénieur en bioinformatique ou informatique.

Compétences scientifiques et techniques requises :
- Bonne connaissance de R et des packages Bioconductor associés, et déploiement des applications sous Shiny,
- Bonne connaissance théorique des approches de bioinformatique pour l'analyse de données NGS (Transcriptome, WGS),
- Programmation en Python, bash

Compétences complémentaires appréciées :
- Utilisation courante d'environnements de calcul haute-performance (cloud ou cluster)
- Expérience dans l'utilisation et le développement avec des gestionnaires de workflow (Snakemake, Nextflow, …)
- Utilisation courante du logiciel de gestion de version git
- Maitrise de l'anglais (niveau B1-B2)
- Intérêt pour le travail en commun avec des biologistes

Compétences relationnelles :
- Goût pour le travail en équipe dans un milieu multidisciplinaire
- Autonomie et sens de l'initiative
- Capacité à s'adapter face à un public de non spécialistes

IMPORTANT : Merci de postuler directement sur le site du recruteur : https://recrutement.cirad.fr/offre-de-emploi/emploi-ingenieur-e-en-bioinformatique-specialiste-de-l-inference-fonctionnelle_5624.aspx