Mots-Clés

RNA-Seq analyse d'image ATAC-Seq génomique séquençage

Description

Notre groupe de recherche propose un poste d’ingénieur d’étude pour prendre en charge les
analyses bio-informatiques associées à différents projets de l'équipe. Nos travaux visent à caractériser
l’hétérogénéité intra et inter-tumorale dans le carcinome hépatocellulaire (CHC), le principal cancer
primitif du foie associé à un mauvais pronostic vital et pour lequel les solutions thérapeutiques restent
limitées. Nous avons développé des modèles précliniques de carcinome hépatocellulaire qui nous
permettent de générer des tumeurs hépatiques déclenchées par des différentes combinaisons
d'événements oncogéniques. Nous analysons entre autres les modifications des transcriptomes des
cellules tumorales et les changements du microenvironnement tumoral. Nous étendons les résultats obtenus par l’analyse de biopsies de patients atteints de CHC, notamment grâce à la forte connexion de notre équipe avec le CHU de Montpellier.

L’ingénieur-e d’étude aura en charge l’analyse des données de RNAseq (tumeurs et cellules
uniques), notamment le contrôle de la qualité et réalisation d’analyses différentielles. Il/elle participera à
la mise au point d’outils de bio-informatique, notamment pour l’analyse automatisée d’images issues
d’expériences d’immunofluorescence et immunohistochimie. Il/elle s’appuiera sur le service commun de
l’institut dédié à l’analyse des données biologiques (https://www.igmm.cnrs.fr/service/service-danalyse-
de-donnees-biologiques-complexes/).

Notre équipe développe ses recherches à de l'Institut de Génétique Moléculaire de Montpellier.
Cette unité mixte de recherche CNRS et Université de Montpellier, de 180 personnes réparties en 17
groupes de recherche, 9 services communs et 9 plateformes technologiques et scientifiques constitue
un excellent environnement. L'IGMM est un institut multidisciplinaire dont les travaux ont un impact
international fondamental et appliqué en biologie moléculaire et cellulaire (www.igmm.cnrs.fr).

Compétences :
- Connaissances en bioinformatique, statistiques et génomique fonctionnelle. Des
connaissances générales dans le domaine de la biologie moléculaire, cellulaire et la biologie
du cancer constitueraient un avantage.
- Nous recherchons un/une candidat-e autonome dans l'organisation de son travail,
rigoureux(se), mais également aimant travailler en équipe et transmettre ses compétences.