Mots-Clés

Ingénieur en Bioinformatique Single Cell R, Python marqueurs vasculaires et lymphatiques

Description

Inovarion est un centre de Recherche et d’Innovation créé en 2013. A l’interface entre recherche fondamentale et développement industriel, Inovarion apporte son savoir-faire et son expertise aux grands acteurs publics et privés des Sciences.

Devenu en 8 ans un acteur central de la Recherche et du Développement en France, Inovarion a pour mission principale de contribuer à l’avancée des connaissances scientifiques dans les Sciences du Vivant.

Votre mission principale sera de mener à bien des projets de recherche en participant à leur conception, conduite et réalisation. Vous aurez à définir, mettre en place et exécuter l'ensemble des techniques nécessaires à la réalisation expérimentale des projets de recherche qui vous seront confiés. Vous aurez aussi à traiter, analyser, interpréter les données et valider les résultats. Vous participerez à la diffusion et la valorisation des résultats des programmes de recherche réalisés par Inovarion.

Le premier projet, en région Midi Pyrénées, qui vous sera confié consistera à identifier de nouveaux marqueurs vasculaires et lymphatiques dans un contexte de remodelage du tissu adipeux par l’analyse des données issues de single-cell RNA sequencing.

Vous serez en charge des missions suivantes :
1/ Identifier de nouveaux marqueurs des vaisseaux lymphatiques dans un contexte d’obésité issus des données de single-cells RNA sequencing:

- Identification des sous-populations de cellules endothéliales lymphatiques

- Identification de nouveaux marqueurs des vaisseaux lymphatiques encomparaison avec les cellules endothéliales des vaisseaux sanguins

- Analyses des données issues de single-cell RNA sequencing déjà publiées

2/ Identification de l’expression différentielle de gènes au cours du lymphœdèmeavec une analyse single-cell RNA sequencing :

- Analyses des populations cellulaires et leur changement d’expression géniqueau cours du lymphœdème

- Identification des populations en relation avec les données déjà publiées.

Le poste est à pourvoir dès que possible.

Compétences requises:

o Single Cell

o RNA-seq
o Analyses de données
o Analyses de populations cellulaires
o Analyses des changements d'expression génique
o Langages de programmation : R, Python