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Qu'est-ce qu'un.e bioinformaticien.ne ?

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Fiche métier générique bioinformaticien produite par le groupe de la travail sur les métiers de la Bioinformatique (MetBif) de la Société Française de Bioinformatique (SFBI).

Où trouver les offres d'emploi/stage.... via le site de la SFBI

La SFBI se donne pour mission de mettre à disposition de la communauté bioinformaticienne française un support de diffusion d'offres d'emplois et de stage dans le domaine de la bioinformatique évidemment mais plus largement en informatique et en (bio)statistiques.

 Les offres en cours sont catégorisées selon le niveau détude (minimum pour les offres d'emplois, en cours pour les offres de stages), le type de poste (ingénieur, chercheur, ...), le type de contrat et leur durée, le lieu et les dates importantes de l'annonce. Les annonces sont majoritairement française, mais nous avons de plus en plus de proposition ailleurs dans le monde.

Ces offres sont classées selon leur date de publication, mais n'hésitez pas à filtrer trier et explorer l'ensemble des annonces. Par ailleurs, nous maintenons une liste de diffusion pour recevoir chaque semaine les nouvelles offres.

Comment connaitre les domaines les plus demandeurs ?

Chaque année, la SFBI publie un bilan des offres proposées sur l'année passée. Cela nous permet de suivre les tendances en terme de types d'emplois, mais aussi thématiques, ou zones géographiques

- Le premier bilan, pour l'année 2021 (à partir d'avril), fait état de 735 annonces. Consultez l'article détaillé pour visualiser leur répartition.

- Bilan année 2022 (Janvier-Décembre), 1044 annonces ont été publiées. Plus de détails dans cet article.

- Bilan année 2023 (Janvier-Décembre), 866 annonces ont été publiées. Plus de détails dans cet article

- Bilan année 2024 (Janvier-Décembre), 822 annonces ont été publiées. Plus de détails dans cet article

- Bilan année 2025 (Janvier-Décembre), 682 annonces ont été publiées. Plus de détails dans cet article

Et après, se faire un réseau : l'exemple de MERIT et de BioInfoDiag

Le Réseau MetiER en bIoinformaTique (MERIT) vise à fédérer les ingénieurs en bioinformatique des établissements d’Enseignement Supérieur et Recherche (ESR) à l’échelle nationale afin de contribuer à structurer cette communauté en favorisant les échanges.

Le Réseau Français de Bioinformatique pour le Diagnostic (BioInfoDiag) est une association Loi 1901 qui vise à  regrouper les différentes communautés d’utilisateurs et de développeurs d’algorithmes et de pipelines bioinformatiques pour le diagnostic et la prise en charge des pathologies humaines en lien direct ou indirect avec la génomique.

Boutique Tunetoo inacessible

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Nous vous informons que la boutique Tunetoo SFBI a été désactivée pour une durée indéterminée.

Le bureau de la SFBI essaie d'entrer en contact avec la société Tunetoo depuis maintenant plusieurs mois mais sans succés.

Tant que nous n'aurons pas réussi à avoir des informations de la part concernant notre boutique, celle-ci sera désactivée.

Nous nous excusons pour la gène occasionnée.

Rencontre des réseaux ouest-africains et français autour de la bioinformatique

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Du 15 au 17 décembre 2025, une délégation de l’Institut Français de Bioinformatique (IFB/ELIXIR-FR), de la Société Française de Bioinformatique (SFBI) et de l’Université de Montpellier a été invitée au lancement du Réseau ouest Africain des Bioinformaticiens et Administrateurs de Systèmes (RABIAS), organisé par le centre de recherche d’excellence WAVE (Central and West African Virus Epidemiology for Food Security) et l’IRD (Institut de Recherche pour le Développement).

L’initiative RABIAS fait suite à la deuxième édition du Certificat International de Bioinformatique et Génomique (CIBiG) en Afrique de l’Ouest et à une formation au cluster HPC d’un groupe d’administrateurs systèmes de pays de la sous-région. Le réseau RABIAS a pour objectif de fédérer les communautés de bioinformaticiens, d’administrateurs systèmes et d’usagers de la région ouest africaine afin d’impulser la mutualisation de ressources humaines et matérielles et de stimuler la montée en compétence des équipes de recherche locales.

La rencontre réunissait à Abidjan (Côte d’Ivoire) les acteurs clés du séquençage, de la bioinformatique, et de l’administration systèmes des ressources de calcul de la région ouest africaine (Côte d’Ivoire, Burkina Faso, Bénin, Nigéria, Togo, Tchad, République Démocratique du Congo, Ghana, Guinée et Niger), ainsi que des représentants de l’African Society for Bioinformatics and Computational Biology (ASBCB) et du Pan African Bioinformatics Network (H3ABioNet).

Les trois journées alternaient présentations, retours d’expériences et ateliers en petits groupes afin de définir les besoins, les moyens et les priorités stratégiques. Les présentations scientifiques fournissaient un aperçu de travaux de recherche dans les domaines phares tels que génomique humaine, surveillance génomique des pathogènes, phytopathologie, résistances aux antimicrobiens, ainsi que les enjeux liés au déploiement d’infrastructures HPC distribuées.

Retours d’expériences des instances françaises invitées

Afin d’illustrer la complexité des problématiques liées au montage de réseaux, les acteurs invités ont partagé leurs expériences concernant la formation, l’infrastructure et la mutualisation des ressources (matériel et humains). L’IFB a présenté sa structuration en tant que fédération de plateformes régionales et que noeud français du réseau ELIXIR, l’organisation de son réseau national de ressources numériques (NNCR), et ses actions de formation continue et de développement des compétences. L’Université de Montpellier (UM) a présenté un panorama des formations diplômantes en France, suivi d’un focus sur son Master en Bioinformatique, mettant en avant l’apport des nouvelles approches pédagogiques des Montpellier Omics Days et du Bioinformatics Learning Lab. La SFBI a présenté son organisation et ses principales missions, en mettant l’accent sur ses interactions avec les autres acteurs de la bioinformatique française ainsi que d’autres réseaux internationaux de bioinformatique.

L’ensemble des discussions et des ateliers de travail ont permis d’identifier des priorités et des actions à mettre en œuvre pour le développement et la maturation du réseau RABIAS. À l’issue de cette rencontre un comité directeur inter-instituts et international a été identifié et des groupes de travail constitués par des participants ont pris l’engagement de mettre en œuvre les actions prioritaires planifiées pour 2026. Cette rencontre a permis de poser les premiers jalons du réseau et de montrer le dynamisme et l’implication de la communauté dans cette initiative. Rendez-vous est pris pour une future édition !

Enquête MERIT / SFBI sur les conditions de travail des bioinformaticiens.nes

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Huit ans après la première réflexion lancée par la SFBI dans le cadre du GT MetBif (Métier de la Bioinformatique), conduisant en 2021 à la rédaction d’une première fiche métier (https://zenodo.org/records/5513972#.YZ9qPVPjJKM ), le GT métier de MERIT et la SFBI vous proposent de répondre à un nouveau sondage destiné à l’ensemble de la communauté bioinformatique.

L'objectif est de disposer d'une vision globale des conditions de travail des bioinformaticiens et bioinformaticiennes dans les instituts de recherche, les universités et établissements d’enseignement et recherche mais aussi dans le secteur associatif ou privé.

Les résultats de cette enquête feront l’objet de communications lors des journées d'animation du réseau métier MERIT et de JOBIM Strasbourg. Il s'agit du premier jalon du travail conjoint de la SFBI et de MERIT visant à revaloriser les métiers de la bioinformatique à l'échelle nationale.

Les informations que vous nous fournirez ne seront ni transmises à un tiers, ni publiées sous leur forme brute. Tout sera mis en œuvre pour que les conclusions tirées des réponses ne permettent aucune inférence sur l'identité des répondants.

Enquête MERIT-SFBI sur les conditions de travail des bioinformaticiens.nes : https://framaforms.org/enquete-merit-sfbi-sur-les-conditions-de-travail-des-bioinformaticiensnes-1760512193

Le temps nécessaire à sa complétion est estimé à 20 minutes. La date limite de réponse est fixée au 31/03/2026.

Nous vous remercions par avance pour votre participation qui sera précieuse pour disposer d’une vision précise des conditions professionnelles dans lesquelles se déroulent vos activités de bioinformatique, et de leurs évolutions récentes. 

On compte sur vous, que vous soyez bioinformaticien.ne de formation ou non, ce sondage vous concerne !

Le GT métier de MERIT & la SFBI

Maîtresse de conférence multi-facettes

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Le 18/12/2024

Carte d'identité:

Entretien

Quels sont vos domaines de recherche ou d’expertise ?

En tant que maîtresse de conférence, il y a deux volets à mon métier. Côté enseignement, j’ai une expertise pédagogique, à la fois en formation initiale pour les étudiant·es de mon établissement, mais aussi en formation continue. Je reste très motivée par le challenge d’enseigner la bioinformatique à un public issu de la biologie. Côté recherche, c’est en génomique !  Initialement en épigénomique, puis en transcriptomique. En rejoignant la plateforme GenomiqueENS, je me suis rapprochée des séquenceurs, et je reste encore aujourd’hui fascinée par ces machines et leur technologie.

En tant que responsable scientifique de cette plateforme, et comme une des directrices adjointes de l’Institut Français de Bioinformatique (IFB), mon expertise se situe autour du management, du pilotage stratégique, d’animation de réseau, et de représentation. Des activités dont je ne connaissais pas vraiment l’existence il y a encore quelques années !

Quel rôles exercez-vous ? Concrètement, en quoi cela consiste ?

Auprès des étudiant·es de l’ENS et des thésard·es que j’encadre, mon rôle est de les accompagner dans leurs apprentissages de la bioinformatique, en les suivant sur plusieurs années vers leur projet professionnel.

Au sein de la plateforme, mon rôle est d’assurer que l’équipe a tout ce qu’il faut pour mener leurs propres missions. J’apporte mon expertise scientifique pour nos projets de recherche et développement, basés sur les domaines d’expertises de nos ingénieur·es, en particulier la transcriptomique en lecture longue Nanopore.

Au sein de l’IFB, mon rôle est entre autres d’animer le réseau des plateformes, distribué sur toute la France.  Concrètement, j’organise des réunions, et beaucoup de visioconférences !

Collaborez-vous avec des biologistes ? Quel type de collaboration est-ce ?

La plateforme permet aux chercheurs de réaliser leurs projets de transcriptomique, de l’échantillon jusqu’à l’analyse bioinformatique et la publication des résultats. Notre équipe comporte donc des ingénieur·es biologistes en charge de la partie expérimentale, et des ingénieur·es  en bioinformatique. Collaborer avec des biologistes est donc au cœur même de notre organisation, et de nos activités avec les chercheurs.

Quel avenir imaginez-vous pour la bioinformatique ?

La bioinformatique n’échappe pas à la révolution qu’apporte l’intelligence artificielle. Dans les années à venir, le développement de nouvelles méthodes va être foisonnant ! Pour autant, l’accessibilité des outils bioinformatiques de pointe ne peut pas se restreindre aux seuls bioinformaticien·nes. Un des enjeux est d’assurer des interfaces adaptées aux biologistes, sur des infrastructures de calcul haute-performance. L’IFB joue un rôle clef en France sur ces aspects, et aussi pour former les biologistes à la bioinformatique, leur permettant ainsi de mieux communiquer avec les bioinformaticien·nes et de répondre à leurs questions biologiques. Enfin, un des enjeux de la bioinformatique est d’assurer la reproductibilité des analyses, la mise à disposition de données (vraiment) réutilisables, dans un contexte de science ouverte.

Votre message à destination des étudiants/jeunes bioinformaticien·nes ?

La communauté française en bioinformatique est vraiment dynamique et sympa. Ne restez pas seul·e dans votre coin ! Etape 1 : adhérez gratuitement à l’association Jebif, ils sont là pour vous donner plein de conseils et vous faire rencontrer d’autres jeunes bioinformacien·nes. Etape 2 : lisez le blog bioinfo-fr.net et découvrez leur canal discord. Etape 3 : élargissez encore un peu vos horizons en lisant la newsletter Les Bioinformations. Etape 4 : vous êtes en stage/thèse/contrat => rendez-vous à JOBIM, l'événement annuel de la bioinformatique piloté par la SFBI, pour y présenter vos travaux pour la première fois, et rencontrer la communauté. Etape 5 : envie de travailler avec d’autres bioinformaticien·nes ? Identifier les réseaux près de chez vous et les groupes de travail thématiques via le réseau métier MERIT.