Société Française de Bioinformatique

Mots-Clés

transcriptomique biostatistiques cancer, genomique

Description

L’ingénieur conduira l’analyse bio-informatique / bio statistique des études de génomique / transcriptomique produites par la plateforme de génomique de l’Institut Cochin dans le cadre des projets SIRIC menés sur le site Cochin. L’ingénieur conseillera l’équipe de recherche dans son design expérimental, réalisera les analyses bio statistiques suivant une méthodologie adaptée, rédigera le rapport d’analyse et accompagnera l’équipe dans le suivi de son projet.

Activités :

- Choisir et adapter les méthodes d’analyse au contexte expérimental des projets (modèles statistiques). - Développer, mettre en œuvre et appliquer des procédures de traitement automatisées sous R (contrôles qualités, normalisation des données, alignement, comptage de lectures, …) des données NGS répondant aux besoins du projet. - Assurer le retour d’analyse auprès des équipes (rédaction et présentation d’un rapport d’expérience). - Vulgariser l‘analyse statistique vers les biologistes et participer à la rédaction d’articles scientifiques. - Participer avec les autres bio-informaticiens de la plateforme au développement de la discipline (groupes de travail, animation technique). - Assurer une veille scientifique et technologique dans son domaine d’activité.

Ce CDD de 12 mois est basé sur la plateforme de genomique de l'Institut Cochin et financé par le SIRIC Carpem.

L.e.a candidat.e doit justifier d’un Bac+5/Master en bio-informatique. Une expérience dans le domaine de la bio-informatique appliquée au séquençage haut-débit sera appréciée.