Société Française de Bioinformatique

Mots-Clés

modélisation comparative, dynamique moléculaire, docking, GPCR

Description

Les phytocannabinoïdes sont une classe de produits fortement mis en lumière récemment pour leurs propriétés « bien-être » mais aussi pour leur impact sur la santé (labélisé en ‘cannabis thérapeutique’). Des modifications modestes de structure chimiques comme celles qui existent entre le THC (Δ9-tétrahydrocannabinol) et le CBD (cannabidiol), de même masse moléculaire, donnent des produits aux propriétés très différentes sur l’organisme (le 1er possède des propriétés psychotropes, ce qui n’est pas le cas du second) alors qu’ils interagissent tous les deux sur les récepteurs cannabinoïdes CB1 et CB2, appartenant à la famille des récepteurs couplés aux protéines G de classe A (GCPR). Une revue récente1 fait état des interactions moléculaires connues entre ces molécules cannabinoïdes et les récepteurs CB1 et CB2 sur la base de la biologie structurale et d’études informatiques associées. Nous proposons d’aller plus loin dans ce type d’étude et de modéliser les interactions entre les récepteurs CB1 et CB2 et des cannabinoïdes structuralement très proches mais ayant des propriétés différentes, les cannabinoïdes mineurs, par exemple le CBG (cannabigérol), le CBN (cannabinol), le CBC (cannabichromène) mais aussi le CBDV (cannabidivarine). Pour ce faire, l’étudiant sera emmené à mettre en œuvre des approches diverses et variées de la bioinformatique structurale et de la modélisation moléculaire (modélisation comparative, simulations de dynamique moléculaire, amarrage moléculaire et calculs d’énergie libre) afin d’étudier les interactions entre ces molécules et le récepteur, ainsi que leur impact sur le comportement dynamique de ce dernier.

Ce domaine de recherche est en progrès très rapide et bientôt de nouvelles données structurales et des informations sur les interactions cannabinoïdes/récepteurs seront disponibles. Pour la société CHANVREINE qui propose ce stage de M2 en collaboration avec l’équipe DSIMB du laboratoire BIGR, l’objectif est d’affiner et de mieux cibler à moyen terme sa proposition de nouveaux produits pour le bien-être et la santé à partir des éléments extraits de l’étude proposée.