Mots-Clés

Computational Network Biology, Machine Learning

Description

L’UMR Canther développe une approche de biologie des systèmes et d’intelligence artificielle afin d’étudier l’écosystème tumoral à différents niveaux d’échelle et de manière dynamique. Ceci passe par l’inférence et la modélisation des réseaux moléculaires impliqués dans la progression tumorale, la confrontation aux données expérimentales et la définition de boucles itératives entre modèle et expérimentation.

L’IGE participera à la mise en place d’un plateau technique de bio-informatique et biologie des systèmes CANTHER-XAI (Explainable AI-based systems biology and cancer therapeutics).

Compétences :

• analyser et résoudre les problématiques bio-informatiques dans le cadre des programmes de recherche des équipes
• concevoir, développer et déployer des outils bio-informatiques
• réaliser la gestion et l'analyse des données « omiques " 
• De plus, l’ingénieur pourrait être amené à consacrer une partie de son activité́ à l’animation de réunions bio-informatiques ainsi qu’à l’encadrement scientifique si nécessaire.

Connaissances attendues :

• Connaissances dans le domaine de biologie des systèmes et de la bio-analyse données à large échelle (transcriptome, protéome, altérations génomiques, mutations, ChIP-seq, criblages fonctionnels à large échelle).
• Connaissances approfondie en apprentissage statistique (modèles de régression, clustering, inférence et fouille de graphe, deep learning) et méthodes de modélisation, analyse et simulation de réseaux de régulation (concepts de la théorie des graphes, d’équations différentielles, les formalisations booléennes ou logique).
• Maitriser au moins un langage de programmation parmi Python et R. Des connaissances en des technologies Web.