Mots-Clés

Développements Informatiques, Portails biodiversité, Science ouverte, GBIF, INPN OpenObs

Description

Contexte

L'Institut de Systématique, Evolution, Biodiversité (UMR ISYEB, du CNRS, MNHN, SU et EPHE) a pour objectif d'étudier l'origine de la biodiversité, la diversification et l'évolution des taxons dans le temps et dans l'espace par des approches intégratives. L'unité est impliquée dans les grands programmes internationaux tels que le GBIF. Le poste sera rattaché à cette unité, et le travail mené conjointement avec l'Unité PatriNat.

L’Unité Patrinat (UAR PatriNat, de l’OFB, MNHN et CNRS) est le centre d’expertise et de données sur la nature. Cette unité est chargée de l’élaboration de méthodes, référentiels, expertises et outils communs pour de nombreux acteurs de la conservation de la nature. Elle assure également la diffusion de connaissances et de données sur la nature vers tous les publics (grand publics, experts, décideurs…), notamment via un site web http://inpn.mnhn.fr. L’INPN (suite applicative) est la plateforme nationale du Système d’Information de l’inventaire du patrimoine naturel (SINP) qui est inclus dans le Système d’Information de la Biodiversité (SIB).

Le point nodal GBIF France est intégré à PatriNat, organisé en cellule au sein de l’équipe Centre de Données et de Service. Il met à disposition les outils, logiciels et services développés par le GBIF (Système mondial d'information sur la biodiversité), compatibles avec les standards internationaux définis par le TDWG (Biodiversity Information Standards - https://www.tdwg.org/) pour remonter les données françaises au niveau international et les rendre accessibles sur le portail gbif.org.

Le GBIF France contribue à la communauté des « Living Atlases », basée sur les modules de la plateforme ALA (Atlas of Living Australia) pour le déploiement de portails de données. Le SINP s’appuie sur ces outils pour mettre à disposition ses données au niveau national et international et diffuser les 120 millions d’observations produites par les acteurs français (https://openobs.mnhn.fr/)

Liens

Sites institutionnels :

https://www.patrinat.fr/fr

Portails de diffusion :

https://openobs.mnhn.fr/

https://inpn.mnhn.fr/accueil/index

https://www.gbif.org/   

http://www.gbif.fr

https://living-atlases.gbif.org/

Le poste

Le titulaire aura la responsabilité de la mise en œuvre, du suivi et de la maintenance des systèmes d’information du GBIF France et du portail OpenObs, et de leur adaptation dans le cadre d’utilisations nationales ainsi que de la contribution à l’évolution de ces outils dans la communauté internationale.

L’ingénieur travaillera en lien avec les développeurs de l’équipe Applications informatiques, les gestionnaires de données de l’équipe Données et analyse ainsi qu’avec  le réseau des informaticiens de la communauté GBIF/ Living Atlases

Missions :

• Développer et maintenir les outils du GBIF France et les site OpenObs
• Organiser et gérer les différents projets informatiques,
• Former et assister techniquement les utilisateurs notamment sur les outils du GBIF et la connexion des données,
• Participer au réseau international GBIF et en particulier au réseau des développeurs.
• Participer aux autres projets informatiques liés portés par Patrinat : en particulier le SIB et le Pôle National des données de Biodiversité (PNDB)

Activités principales :

• Développer, maintenir et documenter les applications web développées :
  • Développer, maintenir et développer de nouvelles fonctionnalités sur OpenObs , application fondée sur Atlas of Living Australia (ALA) - GBIF
  • Développer des outils/process pour automatiser la connexion des données entre INPN et GBIF ainsi qu’entre l’INPN et les plateformes régionales du SINP (notamment par le développement d’API, de procédures d’export, etc.)
  • Participer au développement de nouveaux modules, à la maintenance et aux évolutions de la suite applicative de l’INPN, GBIF, PNDB
  • Gérer ces projets informatiques en lien avec les équipes « métiers »

• Participer à la communauté technique internationale autour des modules d’Atlas of Living Australia, dénommée communauté LA « Living Atlases » en participant aux groupes de travail et aux développements
• Assurer la qualité du code des programmes informatiques et accompagner leur utilisation ;
  • Respecter les procédures de développement
  • Superviser le projet technique (tests, documentation) ;
  • Former et venir en aide techniquement aux utilisateurs,
  • Aider à déployer ces modules au niveau national et dans le cadre de partenariat avec les pays du Sud

• Présenter les activités de Patrinat, notamment les outils et services du GBIF et OpenObs dans différents congrès, séminaires et ateliers (nationaux ou internationaux)
• Assurer une veille permanente sur les évolutions technologiques ;

Cette liste d’activité n’est pas exhaustive, l’agent pourra réaliser d’autres tâches confiées par son responsable. Des déplacements (missions courtes en France et à l’international) sont à prévoir.

Profil recherché

Ingénieur développement informatique expérimenté

Connaissances :

• Connaissance dans les technologies liées aux web-services (REST, JSON)
• Connaissance en gestion / pilotage de projet informatique
• Très bonne maitrise de l’anglais oral et écrit
• Connaissance des standards de données nationaux/internationaux de la biodiversité

Savoir-faire opérationnel :

• Langages :  Java, Groovy, Scala, Python, SQL, Javascript, HTML5, CSS 3, PHP
• Frameworks : Grails, Struts, CakePHP, SPRING MVC
• SGBD : MySQL, PostgreSQL, Cassandra. Indexation : SolR / SolR Cloud / Elastic Search
• Data management: Spark, Hadoop, Apache NiFi, Apache Beam
• IDE : IntelliJ
• Administration Système : Linux/Ubuntu Server
• DevOps : Maven, Gradle, Docker, Ansible 

Savoir-être professionnel :

• Organisé et autonome
• Savoir s’auto-former sur des sujets techniques et fonctionnels
• Sens de la communication et de la pédagogie (formation, utilisateurs...)
• Adaptable et travail en équipe
• Esprit d’initiative

Qualification appréciée :

Motivation pour les aspects scientifiques et les enjeux liés à la biodiversité      

Relations professionnelles

En interne :

PatriNat (autres équipes), Services de l’OFB (DSUED, DSI…), équipes du MNHN (DINSI, UMR ISYEB BBEES, Direction des collections)

En externe :

MTECT, MESR, Etablissement de recherche, acteurs du PNDB, réseaux internationaux GBIF et TDWG