Modèles physiques décrivant la translocation de protéines à travers des membranes
CDD · Thèse · 36 mois Bac+5 / Master Laboratoire de Physique et Chimie Theoriques · Metz (France) 37000 euros brut par an
Date de prise de poste : 1 octobre 2023
Mots-Clés
interaction protéine membrane modélisation mesoscopique toxines
Description
Le sujet de thèse concerne la mise au point de modèles physiques décrivant la translocation de protéines à travers des membranes. Ces modèles seront basés sur une modélisation mésoscopiques des systèmes, et calibrés à l’aide de simulations de dynamique moléculaire tout-atomes. Les protéines étudiées sont des toxines botuliques ou des cytolysines. Leur toxicité est reliée à un passage à travers une membrane cellulaire ou vésiculaire. La modélisation mésoscopique sera basée sur des approches à gros grains (coarse-grained) ainsi que sur des approches de géometrie différentielle considérant la membrane comme une surface plane. Les mécanismes de translocation proposés grâce à la modélisation permettront d’envisager des expériences de validation, en particulier par Résonance Magnétique Nucléaire (RMN), pour lesquelles des collaborations ont déjà été établies. L’élucidation de ces mécanismes présente une importance cruciale pour le développement d’anticorps ciblant spécifiquement les protéines d’intérêt.
Candidature
Procédure : envoyer un mail a Martin Michael Müller, Université de Lorraine, martin-michael.mueller@univ-lorraine.fr https://lpct.cnrs.fr/lannuaire/name/martin-muller/ http://www.geomnat.com/index_en.php Thérèse Malliavin, CNRS et Université de Lorraine, therese.malliavin@univ-lorraine.fr https://lpct.cnrs.fr/lannuaire/name/therese-malliavin/ https://www.researchgate.net/profile/Therese-Malliavin
Date limite : 25 mars 2023
Contacts
Therese Malliavin
thNOSPAMerese.malliavin@univ-lorraine.fr
Offre publiée le 24 février 2023, affichage jusqu'au 25 mars 2023