Mots-Clés

Biomédicaments, bioinformatique, simulations, protéine, modélisation, prédiction, intelligence artificielle, apprentissage automatique, optimisation, analyse de données, programmation, informatique,

Description

Au cours de la production d’un biomédicament, les industriels constatent des pertes significatives de produit actif. Ces pertes d’activité résultent des différentes étapes mises en œuvre, comme la purification ou le stockage. Les conditions environnementales, telles des variations de température, de pH jouent un rôle clé dans le maintien d’un produit actif.

La société Audensiel Healthcare s’est proposé de mettre en place un outil d’aide à la décision nommé AIDRUG pour la conception de biomédicaments, incluant le design de celui-ci jusqu’à la mise en place des conditions optimales de sa production industrielle.  Le projet de thèse repose sur l’hypothèse que les pertes d’activité du produit sont dues à des changements structuraux et/ou dynamiques pouvant conduire à de la dénaturation ou à des phénomènes d’agrégation.

Il s’agira donc d’étudier finement les risques associés aux très basses températures rencontrées lors de la cryogénation du produit, à examiner l’impact de certains excipients ainsi que celui du pH. Une première étape consistera à produire des données à l’aide des méthodes avancées d’échantillonnage conformationnel et des méthodes adaptées pour examiner l’effet du pH. L’impact des différents facteurs sur les zones fonctionnelles sera exploré. L’élucidation des mécanismes responsables de changements dans ces régions permettra d’identifier des descripteurs pertinents qui pourront être exploités lors de la seconde étape, qui consistera à entraîner des méthodes d’apprentissage afin de prédire l’effet observé et donc en retour à proposer les paramètres optimaux limitant ce risque.