Société Française de Bioinformatique

Mots-Clés

Brain tumors, gliomas, cancer stem cells , single cell RNA seq, biobanque

Description

L’équipe “Plasticité cérébrale, cellules souches et tumeurs gliales” située à l’Institut de Genomique Fonctionnelle (Direction  JP Hugnot,  H Duffau)  recrute un bioinformaticien(ne) niveau Ingénieur pour une durée d’une année. L’équipe travaille sur la constitution et l’annotation détaillée  d’une biobanque de lignées de tumeurs cérébrales   (gliomes) issues de résection de patients. La personne sera notamment en charge d’analyser des jeux de données récents de l’équipe (RNA seq et single cell RNA seq) notamment via des scripts issus de publications (par ex, SingleCellSignalR, CellChatDB, CellCall, SCENIC, Slingshot, WebCSEA, Panglaodb,Cyclone, recherche de néoantigens, ..). Une interaction avec la société Neovision (Grenoble) spécialisée en IA est aussi prévue. Idéalement, le bioinformaticien(ne) possédera une formation en biologie,  et une expérience en analyse  bioinformatique  des données en single cells.