Ingénieur bioinformatique analyse single cell RNA seq
CDD · Ingénieur autre · 12 mois Bac+5 / Master IGF CNRS Montpellier · Montpellier (France) 2 884,58 € brut mensuel (IR) ou 2 409,72 brut mensuel (IE)
Date de prise de poste : 1 octobre 2023
Mots-Clés
Brain tumors, gliomas, cancer stem cells , single cell RNA seq, biobanque
Description
L’équipe “Plasticité cérébrale, cellules souches et tumeurs gliales” située à l’Institut de Genomique Fonctionnelle (Direction JP Hugnot, H Duffau) recrute un bioinformaticien(ne) niveau Ingénieur pour une durée d’une année. L’équipe travaille sur la constitution et l’annotation détaillée d’une biobanque de lignées de tumeurs cérébrales (gliomes) issues de résection de patients. La personne sera notamment en charge d’analyser des jeux de données récents de l’équipe (RNA seq et single cell RNA seq) notamment via des scripts issus de publications (par ex, SingleCellSignalR, CellChatDB, CellCall, SCENIC, Slingshot, WebCSEA, Panglaodb,Cyclone, recherche de néoantigens, ..). Une interaction avec la société Neovision (Grenoble) spécialisée en IA est aussi prévue. Idéalement, le bioinformaticien(ne) possédera une formation en biologie, et une expérience en analyse bioinformatique des données en single cells.
Candidature
Procédure : Envoyer CV et nom de références
Date limite : 30 décembre 2023
Contacts
jean-philippe.hugnot@umontpellier.fr
jeNOSPAMan-philippe.hugnot@umontpellier.fr
https://www.igf.cnrs.fr/index.php/fr/h-teams-fr/ht-duffau-hugnot-fr
Offre publiée le 5 juillet 2023, affichage jusqu'au 30 décembre 2023