Mots-Clés

Imagerie médicale recalage d'images robotique

Description

Contexte de l’innovation

PETRUS (Positron Emission Tomography Registered Ultrasound) est un système d’imagerie multimodale non invasive simultanée par ultrasons (US, Tomographie d’émission de positons (PET) et tomodensitométrie aux rayons X (CT). C-PETRUS est l’évolution clinique de PETRUS.

PETRUS et c-PETRUS produiset simultanément des images en temps réel de trois caractéristiques principales du vivant

1. Compartimentation des fonctions biologiques en organes et tissus,
2. Transformations chimiques par le métabolisme cellulaire,
3. Échanges matériels via la circulation vasculaire,

PETRUS est une technique d’imagerie du vivant non invasive donc répétable au cours de la vie, de la maladie et de son traitement et capable d’établir les liens colocalisés dans le temps et dans l’espace entre ces trois caractéristiques. A titre d’exemple, l’illustration ci-dessous montre les images PETRUS d’une même tumeur à différents temps de croissance chez une souris.

Voir Provost J, Garofalakis A, Sourdon J, Bouda D, Berthon B, Viel T, et al. Simultaneous positron emission tomography and ultrafast ultrasound for hybrid molecular, anatomical and functional imaging. Nature Biomedical Engineering. Feb 2018;2(2):85‑94.

Objectif

Transfert clinique de PETRUS

Plan d’expériences prévu:

Optimisation de codes et génération des interfaces graphiques. Cette étape est importante pour garantir la reproductibilité des résultats lors du transfert du code en mode clinique. Elle permettra également de contribuer à l'homologation du logiciel selon les règles européennes en tant que logiciel médical. 

Plus précisément,

1. Affiner et interconnecter les codes du projet PETRUS en un seul langage de programmation et en une interface graphique conçue pour être conviviale et utilisable par le personnel médical ou technique. 

2. Coder le logiciel de visualisation en temps réel pendant l'acquisition multimodale. 

Pour le premier point, les codes se trouvent actuellement dans trois langages de programmation : C++, Python et Matlab. De manière générale, les codes sont chargés de trois tâches : (I) la connexion à un robot utilisant le système d'exploitation de robot (ROS) en interfaçant avec Matlab via Ethernet. (II) La connexion à un scanner ultrasonique via Ethernet qui contrôle l'acquisition et la configuration du transducteur. (III) La lecture de données DICOM d'un scanner clinique et son enregistrement multimodal avec les images acquises par (II) en utilisant les informations de positionnement obtenues en (I). 

Pour le deuxième point, nous avons besoin de générer l'interface graphique qui permettra d'afficher en temps réel les informations obtenues par le transducteur sur l'axe de référence des images obtenues avec le scanner clinique. Nos codes actuels peuvent fournir les informations en temps réel de la sonde ultrasonique sur l'axe de référence du scanner clinique, qui servira d'entrée pour le code qui les affichera simultanément sur le même axe de référence pendant l'acquisition. 

Cette étape est importante pour augmenter l'utilisabilité de notre logiciel par les médecins. L'ajout d'une rétroaction visuelle au cycle de fonctionnement du robot augmenterait significativement l'impact de la technique.

Résumé graphique

Formation requise

Diplôme d’ingénieur en informatique et ou robotique

Les compétences requises pour ce poste sont : 

• Programmation en C++, Python, ROS et Matlab 

• Expérience en visualisation des interventions chirurgicales en temps réel 

• Génération d'interfaces graphiques conviviales pour les utilisateurs 

• Vision par ordinateur et enregistrement multimodal Robot Control

Conditions

CDD d’un an. Rémunération selon barème Inserm.

Idéal pour un premier poste dans le domaine de l’ingénierie pour la santé.

L’Inserm est un employeur public qui applique une charte d‘égalité des chances pour tous ses employés.

Poste situé à Paris 15e arrondissement sur le campus du centre de recherche de l’’hôpital européen Georges Pompidou.

Travail en français et en anglais dans une équipe multilingue.

Pas de contraintes horaires ou servitudes.

Contact

Omar ZENTENO, Ingénieur responsable du programme c-PETRUS, omar.zenteno@inserm.fr

01 53 98 79 73 ou bertrand.tavitian@inserm.fr

Site web : http://parcc.inserm.fr/research-teams/team/tavitian/