Société Française de Bioinformatique

A Propos de VIDIUM et du poste

VIDIUM est une jeune startup spécialisée dans la biologie des systèmes et incubée à l’ENS de Lyon. VIDIUM développe des services innovants dans l’analyse des mégadonnées biologiques pour accompagner les biologistes dans leur R&D de nouvelles thérapies-diagnostics en proposant des solutions optimales et la conception rationnelle de nouvelles expériences basées sur des simulations. 

VIDIUM prédit le comportement des cellules soumises à des nouvelles conditions grâce aux modèles mécanistes de réseaux génétiques reconstruits à l’aide de la plateforme R.E.A.L. à partir de données expérimentales. Cette solution s’inspire de l’ingénierie aérospatiale et intègre les dernières technologies de pointes en calcul haute performance et d’apprentissage pour dépasser les limites actuelles en termes de représentativité biologique, capacité prédictive et de passage à l’échelle. 

Mission

En tant que stagiaire en bioinformatique, vous travaillerez au sein de l’équipe bioinformatique en collaboration étroite avec des biologistes des sytèmes. Vous serez chargé.e d’analyser des données expérimentales muti-omics (RNA seq, single cell, etc.) et de caractériser le comportement dynamique des cellules. Le stagiaire devra utiliser des logiciels existants mais aussi développer des nouveaux scripts d’analyses en bash, R et/ou python.  

Descriptif du poste (activités) 

Le ou la stagiaire recruté.e sera chargé.e de : 
1- Analyser les résultats d’expérience multi-omics 

2 - Caractériser un mécanisme cellulaire à l'aide de la littérature et de base de données 

3 - Développer des scripts d’analyses 

Profil recherché 

Nous cherchons une personne issue d’une école d’ingénieur ou un master avec une composante bioinformatique. La curiosité et le goût pour la transdisciplinarité seront fortement appréciés pour s’intégrer pleinement dans une équipe alliant des profils en médecine/business/ingénierie/biologie/mathématique/(bio)informatique/HPC. A terme ce stage pourra aboutir à un CDI.  

Compétences recherchées  

Compétences systèmes (Unix) 

Bonne connaissance en R ou python 

Bonnes connaissances en analyses de données et statistiques 

Connaissances en biologie cellulaires et génétiques 

Maîtrise de l'anglais scientifique lu et écrit