Mots-Clés

Bio informatique

Description

MaaT Pharma est une société de biotechnologie, leader de l’industrie, mettant en œuvre une approche médicale innovante centrée sur le microbiote intestinal afin de traiter des maladies graves dans le domaine de l’oncologie. En nous appuyant sur notre expertise du microbiote intestinal, nos compétences en développement de médicaments et notre plateforme de biologie computationnelle gutPrint®, nous avons développé un pipeline constitué de plusieurs candidats médicaments. Le plus avancé est actuellement évalué en essai clinique de Phase 3. Toujours animés par notre esprit de pionnier, nous sommes aujourd’hui la première société microbiote cotée en Europe continentale, avec une entrée en bourse sur EURONEXT Paris en novembre 2021. Nous avons une approche humaniste de notre aventure entrepreneuriale. Chaque recrutement est l’opportunité de consolider notre capital humain riche et divers, qui dépasse maintenant les 50 personnes.

Actuellement basés à Lyon (7ème), nous recherchons un(e) :

Stagiaire Bio-Informatique (H/F)

Poste ouvert aux personnes en situation de handicap

Description de poste

Au sein de l’équipe bio-informatique gutPrint® Data Analysis, vous travaillerez sur l’évaluation d’outils bio-informatiques pour la reconstruction et l’annotation de génomes à partir de données métagénomiques shotgun. L’objectif de ce stage sera de proposer une solution complète et adaptée à notre volume de données disponibles et futures, comprenant les spécifications techniques pour le développement d’un pipeline ainsi que pour l’environnement de calcul associé.

Vos principales missions

• Effectuer une recherche bibliographique pour identifier les outils bio-informatiques disponibles et les plus adéquats pour réaliser chacune des étapes ;

• Installer et tester les outils présélectionnés sur la base de la littérature ;

• Identifier ou créer des jeux de données simulées pour évaluer les performances de ces outils ;

• Evaluer le volume de données disponibles chez MaaT Pharma et proposer un plan de traitement de ces données;

• Evaluer les ressources de calcul nécessaires et établir les spécifications techniques pour l’environnement de calcul en production ;

• Sélectionner les outils et établir un cahier des charges répondant aux attentes de MaaT Pharma pour le développement d’un nouveau pipeline.

Qualifications et expérience

• Formation Bac +5 en bio-informatique ;

• Maîtrise de l’environnement Linux et de l’interpréteur de commandes Bash ;

• Connaissances solides et expérience dans au moins un langage de programmation pour le calcul scientifique tel que R, Python, C++ ;

• Connaissances en infrastructures Cloud de calcul ;

• Bonnes aptitudes de communication ;

• Vous êtes curieux(se), rigoureux(se) ;

• Vous aimez travaillez en équipe multidisciplinaire ;

• Une première expérience dans l’analyse de données métagénomiques NGS sera un plus.

Travailler chez MaaT Pharma, c'est

Un environnement de travail convivial et stimulant, avec des challenges, au sein d'une équipe passionnée... mais aussi l'opportunité de développer vos compétences et d'évoluer. Si vous êtes motivé(e) pour rejoindre une équipe curieuse et passionnée, à taille humaine et évoluant dans un environnement entrepreneurial et innovant, alors rejoignez-nous en postulant à cette offre ! Si vous êtes intéressé(e) par ce stage chez MaaT Pharma et que vous répondez aux critères ci-dessus, veuillez envoyer un email avec votre CV et votre motivation à : careers@maat-pharma.com.