Société Française de Bioinformatique

Au sein de l'équipe Gene Discovery du département Trait & Technologie de la recherche grande culture de Limagrain, vous conduirez la recherche de gènes candidats pour améliorer la résistance des céréales aux différents pathogènes (virus, champignons ou bactéries) affectant les performances agronomiques de nos espèces cultivées les plus importantes, la mise en place de stratégies d'édition de génome (design guides CRISPR…), l'analyse de plantes éditées et le suivi des plantes au cours du cycle de fixation avant phénotypage.

Vous participez à l'identification de gènes à éditer pour améliorer la résistance des céréales aux maladies virales et fongique et définissez la meilleure stratégie d'édition par design des gRNA, pour proposer des constructions moléculaires. Vous analysez les mutations de plantes éditées pour identifier les plantes d'intérêt qui seront sélectionnées pour les étapes suivantes (fixation, phénotypage). Vous analysez les données transcriptomiques pour identifier des cibles d'intérêt pour la résistance aux pathogènes.

- Expertise dans l'utilisation des outils de bio-analyse (blast, alignement, analyse de séquences, impact de mutations…), environnement Galaxy, utilisation de JBrowse, Logiciel type Geneious
- Expérience dans l'utilisation des technologies d'édition de génomes et de transgénèse (design de guides, analyse moléculaires de mutants, impact des mutations etc...)
- Analyse de données transcriptome, réseaux de gènes etc…
- Veille bibliographique sur une cible d'intérêt
- Biologie moléculaire des plantes serait un plus
- Travailler en équpe
- Communiquer pour partager