Ingénieur.e Bioinformatique / Datamanagement

 CDD · Ingénieur autre  · 36 mois    Bac+5 / Master   AP-HP · PARIS (France)

Mots-Clés

bioinformatique cytogénétique datamanagement

Description

Description du poste

Au sein du pôle Innovation et Données de la DSN de l'AP-HP, la plateforme de bioinformatique MOABI a pour missions :

  • La centralisation progressive du stockage des données de génomique produites au niveau de 39 hôpitaux
  • Leur analyse dans le cadre de processus maitrisés et normalisés
  • La mise à disposition d’outils d’exploitation des résultats
  • L’animation d'une communauté bioinformatique de l’AP-HP regroupant plusieurs dizaines d'ingénieurs
  • Le support technique et scientifique, la formation
  • La veille technologique en bioinformatique

La stratégie mise en place à MOABI pour le développement de pipelines d’analyses permet de garantir un niveau de standardisation, de traçabilité et de reproductibilité de qualité industrielle.

Afin de renforcer ses activités bioinformatiques, la plateforme MOABI recherche un.e ingénieur.e en bioinformatique, dont les missions principales  seront les suivantes :

  • Mettre en place des solutions d’analyse de données pour les cytogénéticiens de l’AP-HP
  • Développer une base de données de variants structuraux (SV) à l’échelle de l’AP-HP
  • Mettre en place et suivre le cycle de vie des données de génétiques 

Compétences professionnelles

  • Excellente connaissance d’un langage de script (Python, Bash)
  • Excellente connaissance de R
  • Excellente connaissance en gestion de données (data management)
  • Expérience en analyses de données cytogénétiques
  • Maîtrise de l'environnement Linux/Unix

Compétences interpersonnelles

  • Excellentes qualités relationnelles et organisationnelles
  • Excellent esprit d'équipe et sens relationnel
  • Excellentes qualités de communication
  • Autonomie, rigueur, méthode
  • Capacité de travail très importante, associée à un fort dynamisme.
  • Curiosité et capacité d’adaptation et d’anticipation
  • Fort intérêt pour le domaine des sciences biologiques et/ou médicales.
  • Adhésion aux valeurs du service public et intérêt prononcé pour le domaine de la santé
  • Adhésion aux valeurs de partage de connaissances et de compétences

Qualifications

Ingénieur(e) A+ et/ou PhD et/ou MD (Bioinformatique, Mathématiques, Biostatistique, Informatique)

Informations

  • CDD de 3 ans à pourvoir dès que possible avec possibilité de télétravail jusqu’à 3 jours par semaines.
  • Dossier de candidature : Lettre de motivation et CV

Contact

guillaume.meurice@aphp.fr et alban.lermine@aphp.fr

Candidature

Procédure : Envoyer CV et lettre de motivation par mail.

Date limite : None

Contacts

Guillaume MEURICE

 guNOSPAMillaume.meurice@aphp.fr

Offre publiée le 2 février 2024, affichage jusqu'au 31 mai 2024