Mots-Clés

haplotagging biologie moléculaire bioinformatique gestion de données terrain

Description

Un poste d'Ingénieur⋅e d'Études (54 mois, 4,5 ans) est à pourvoir avec Pierre de Villemereuil au sein de l'ISYEB (Paris) dans le cadre du projet ERC EvoGenArch. La personne recrutée sera responsable de la mise en œuvre de divers aspects du projet, en particulier ceux liés à l'écologie moléculaire (développement de l'approche d'haplotagging sur le travail de laboratoire et d'analyse informatique, participation au travail de terrain, gestion des données). Le poste offre donc l'opportunité d'explorer un large domaine de l'écologie moléculaire, du terrain à l'analyse en passant par la paillasse, avec le soutien d'une technicienne de laboratoire et d'une bioinformaticienne pour les aspects les plus techniques du travail. Le travail de laboratoire (notamment le développement de l'approche haplotagging au laboratoire pour préparer des librairies Illumina pour du séquençage de génome complet) constituera la majeure partie de la charge de travail, suivi par l'analyse des séquences et la gestion des données. Le travail de terrain représente deux mois par an.

La personne recrutée travaillera pour l'École Pratique des Hautes Études (Université PSL), rejoignant l'équipe de Pierre de Villemereuil (et plus largement l'équipe DIVA), à l'Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité (ISYEB), situé au sein du Muséum National d'Histoire Naturelle (MNHN) à Paris. Ce poste est financé dans le cadre de l'ERC Starting Grant EvoGenArch.

Compétences recherchées :
- Master dans un domaine liés à l'écologie moléculaire (génétique, écologie, biologie évolutive).
- Capacité démontrée à mener à bien un projet de recherche délimité
- Intérêt pour le travail en équipe dans le cadre d'un projet de recherche vaste et ambitieux.
- Expérience du travail de laboratoire et de la biologie moléculaire applicable au génotypage (par exemple, extraction de l'ADN, protocole de génotypage, protocole d'analyse de l'ADN, préparation de librairies)
- Expérience de base en bio-informatique et/ou en gestion de données, par exemple familiarité avec le shell bash, R ou Python
- Intérêt pour le travail de terrain sur le lézard vivipare dans les Cévennes

Plus d'informations au lien suivant:
https://euraxess.ec.europa.eu/jobs/225940