Mots-Clés

bioinformatique NGS plateforme

Description

Contexte du poste :

La plateforme de bioinformatique et biostatistique Bilille est l’une des 8 plateformes de l’unité PLBS (Plateformes Lilloises en Biologie et Santé) au service d’unités de recherche académiques en sciences de la vie et de la santé.
La plateforme Bilille compte actuellement 6 ingénieur.e.s temps plein aux profils complémentaires (bioinformaticiens, biostatisticiens, bioanalystes). Les domaines d’activité de Bilille portent notamment sur l'analyse de données -omiques, la biologie intégrative, la phylogénie, la biologie des systèmes, l’imagerie, et la bioinformatique structurale.
Suite à une mise en disponibilité de 5 ans d’un ingénieur de recherche titulaire de la plateforme, Bilille recrute un Ingénieur de Recherche en bioinformatique possédant une première expérience significative dans la réalisation et l’encadrement de projet traitant de données NGS. Le contrat, en CDD, sera établi pour une durée initiale de 12 mois avec possibilité de renouvellement chaque année durant la disponibilité de l’agent.

Activités principales :

- Assurer la résilation, la conduite ou l’encadrement de projets d’analyse de données biologiques (génomique, transcriptomique, protéomique, ...)
- Diffuser et valoriser les résultats et réalisations technologiques sous forme de rapports, brevets, publications, présentations orales
- Participer au montage de projets collaboratifs
- Assurer et organiser la veille scientifique et technologique dans son domaine d'activité

Activités associées :

- S’investir dans le travail collectif de la plateforme (formation, animation)
- Contribuer à l’activité de développement de ressources originales (packages, logiciels, workflows) au service de la communauté de recherche en biologie et santé, à l’échelle locale, nationale et internationale
- Assurer le support aux utilisateurs pour l’utilisation des ressources HPC (cloud, cluster...).

Compétences attendues et savoirs-faire opérationnels :

- Connaissances avancées des approches de bioinformatique pour l’analyse de données
- Maîtrise de la programmation dans un environnement Linux (Python, R, bash)
- Bonnes pratiques d’analyse et de reproductibilité (Nextflow, Snakemake, Conda, Docker, RMarkdown, ...)
- Notions avancées en biologie (biologie moléculaire et cellulaire, génomique et génétique)
- Interaction avec des profils variés (biologistes, bioinformaticiens, biostatisticiens)
- Capacité d’encadrement et de gestion de projets
- Anglais technique (B2)

Spécificités et environnement du poste : la personne recrutée sera amenée à travailler sur les 3 sites d’implantation de Bilille (accessibles facilement par les transports en commun). Réalisation d’un à deux jours de télétravail par semaine.

Formation requise : master/diplôme d’ingénieur en bioinformatique ou doctorat en biologie avec une forte composante en bioinformatique. Expérience professionnelle d'au moins 12 mois en l'absence de thèse.

Contrat : CDD de 12 mois, renouvelable. Prise de fonction dès que possible.

Rémunération : la rémunération sera fixée suivant l’expérience du candidat et les grilles de l'Université de Lille.

Date limite de candidature : les candidatures seront acceptées jusqu’à ce que le poste soit pourvu.

D'autres postes sont ouverts sur la plateforme, n'hésitez pas à les consulter : https://bilille.univ-lille.fr/news/detailed-news/join-bilille-team