Mots-Clés
machine learning
data science
programmation
epitranscriptome
Description
Structure de rattachement : Laboratoire d'informatique, de robotique et de microélectronique de Montpellier (LIRMM)
Environnement de travail : Nous recrutons un ingénieur en informatique (machine learning et data science) dans le cadre du projet EpiTransDiag financé par la SATT AxLR et qui vise à développer une plateforme analytique de l’épitranscriptome permettant le diagnostic précoce du cancer, la stratification des patients ainsi que le suivi post-thérapeutique. La maturation permettra de consolider la méthode analytique à travers l’étude de cohortes de patients plus conséquentes ainsi qu’à établir un diagnostic prédictif de marqueurs cancéreux sous le format présence/absence de cancer. Une startup a été créée et exploitera les résultats générés durant la maturation.
Mission
Mission principale :
Dans le cadre d’un projet de maturation, nous recrutons un ingénieur informaticien / data scientist dont l’activité principale consistera à :
– assurer le développement d'un pipeline analytique (analyse de machine learning et statistiques) dédié aux données de modifications de ARN
– contrôler la capacité prédictive du pipeline expérimental et analytique pour le diagnostic précoce du cancer et son suivi thérapeutique
– effectuer l'analyse de données d'épitranscriptome pour le diagnostic et le suivi du cancer
– contribuer à établir des signatures épitranscriptomiques pour le diagnostic ou le suivi de cancers
Activités :
– Développement informatique, conception d’algorithmes de machine learning
– Exploration et visualisation de données bio-chimiques
– Développement de méthodes de calculs, démonstration des outils
– Automatisation et sécurisation du traitement de données
– Rédaction de rapport, interaction avec biologistes et biochimistes
– Participation à des réunions, et possiblement à des congrès ou conférence
Notre profil idéal
Diplôme :
• Niveau avancé (> ou égal à BAC + 5) en informatique, type école d’ingénieur ou master universitaire en informatique ou sciences des données
• Composante de programmation informatique
Connaissances attendues :
• Apprentissage automatique (machine learning)
• Science des données (data science) et statistiques
• Programmation en langage python (librairies de ML telles que scikit learn, pytorch, etc)
• Développement logiciel : pratique de gestion et maintenance des logiciels, de tests
• Maîtrise de l’anglais
• Langage C++
• Programmation de visualisation de données avec interface dynamique
Expériences professionnelles :
• Expérience 1 à 3 ans en développement d’algorithmes de machine learning (apprentissage automatique) et de logiciels.
Qualités humaines :
• Forte motivation et engagement professionnel
• Professionnalisme en particulier en termes de qualité du travail accompli
• Bonne capacité d’apprentissage et d’écoute
• Capacité d’interaction et de travail en équipe