Mots-Clés

Research Software, Computational Network Biology, Machine Learning, Cancer

Description

L'équipe  DISCO (http://canther.fr/en/team-digital-systems-and-computational-cancer/) au sein de l'Institut ONCOLille, et le laboratoire CANTHER (UMR9020 CNRS - UMR-1277 Inserm), développe des projets liés à l'intelligence artificielle et à la biologie des systèmes du cancer. Notre objectif est d'élucider et d'étudier les réseaux de régulation dans le contexte de l'hétérogénéité tumorale et de la résistance aux thérapies.

L’IGE/R assumera la responsabilité technique du plateau CANTHER.AI (https://canther.fr/fr/plateau-de-bioinformatique-canther-xai/).

Compétences requises :

• Développer et déployer des outils bio-informatiques.

• Analyser et résoudre les problématiques bio-informatiques dans le cadre de projets de recherche collaboratifs 

Connaissances requises :

Maîtrise avancée de R et R Shiny pour le développement d'applications bioinformatiques, avec des connaissances en développement web (HTML, CSS, JavaScript) et gestion d'environnements cloud (Google Cloud, AWS, ..).

Expérience en  pipelines d'analyse de données omiques et intégration de bases de données biologiques (transcriptome, protéome, altérations génomiques, mutations, ChIP-seq, criblages fonctionnels à grande échelle).

Maîtrise des techniques d'apprentissage statistique ainsi que des méthodes de modélisation, d'analyse et de simulation de réseaux de régulation.