Profil de poste

Emploi type

Ingénieur de recherche (IR)

BAP

Informatique, statistiques et calcul scientifique

Missions

L’ingénieur de recherche sera en charge de la gestion des données brutes multimodales : puces ADN, données cliniques, et autres données liées aux troubles du neuro-développement.

• Collecter ces données pour les unités du service de pédopsychiatrie sur l’espace de stockage NAS mis en place à l’hôpital en améliorant les procédures existantes.
• Organisation et structuration de la base de données, mise à disposition des données uniformisées pour analyses.
• Développement d’une interface utilisateur permettant d’accéder aux examens réalisés par chaque sujet de manière centralisée (JavaScript, MongoDB).
• Poursuite du travail de prétraitement des données multimodales, notamment d’anonymisation des données mis en place afin d’identifier chaque sujet par un master code unique. Conservation sécurisée de la correspondance sur serveur interne.
• Suivi des protocoles de recherche pour lesquels l’hôpital est centre d’inclusion, acquisition des données, formatage et livraison au PI selon les exigences de chaque projet.

Activités principales

• S’assurer de la bonne collecte des données dans chaque service selon la méthode et le logiciel spécifique.
• Mettre en place et maintenir des bases de données anonymisées.

Activités associées

• Organiser et participer à la maintenance et à l’évolution de l’environnement informatique du laboratoire.
• Participer activement à la valorisation scientifique des projets de recherche.
• Participer à la vie de laboratoire.

Connaissances

• Expertise avancée en gestion de données et programmation informatique (environnement UNIX, Python, Matlab, shell scripting, JavaScript).
• Développement Web (Vue.js, MongoDB, HTML/CSS).
• Maitrise de l’anglais souhaitable.

Savoir-faire

• Organiser et gérer une base de données.
• Adapter et développer des pipelines de traitements des données.
• Savoir faire le lien vers des utilisateurs non-experts.
• Gérer les priorités et interagir avec des experts variés (cliniciens, chercheurs, informaticiens).

Aptitudes

• Autonomie, dynamisme, rigueur, et aptitude à organiser/animer un groupe de support.
• Bon relationnel et capacité à rendre compte

Spécificité(s) / Contraintes du poste

• Veiller à la gestion cohérente et sécurisée des banques de données avec les données cliniques recueillies
• Réaliser des déplacements sur différents laboratoires en Ile de France (Institut Pasteur, NeuroSpin CEA Saclay, …) de manière ponctuelle.
• Respect de la confidentialité des informations.

Expériences souhaitées

• Expérience confirmée en gestion de base de données

Diplôme souhaité

• École d’ingénieur, master 2 (BAC +5)

Structure d’accueil

Code unité

Intitule

Centre d’excellence InoVAND

Responsable

Pr R. Delorme

Composition

• Le centre d’excellence InoVAND regroupe plus d’une trentaine qu’équipes cliniques et scientifiques, mais aussi des associations.
• Il est piloté par le service de psychiatrie de l’enfant et de l’adolescent composé d’1 Chef de service, 12 PH, 2 CCA, 9 internes, ainsi que du personnel non médical (psychologues, orthophonistes, IDE, Logisticien, …)
• L’objectif du centre InoVAND est de promouvoir la recherche, et la clinique pour offrir des soins d’excellence en partenariat avec un réseau d’associations.

Adresse

Hôpital universitaire Robert Debré

48 bld Sérurier

75019 Paris

Metro 11 Porte des Lilas, 7bis Près Saint Gervais

Contrat

Type

CDD

Durée

Durée de 12 mois, avec possibilité de renouvellement

Rémunération

Statut ingénieur de recherche, échelon négociable

Pour postuler

Documents pour candidater

CV, lettre de motivation, 2 lettres de recommandation ou coordonnées de 2 personnes référentes

Contacts

Richard Delorme richard.delorme@aphp.fr; Édouard Duchesnay edouard.duchesnay@cea.fr

Aurélie Bourmaud aurelie.bourmaud@aphp.fr; Ana Vergnon ana.vergnon@aphp.fr; Robin Bonicel  robin.bonicel@aphp.fr