Mots-Clés

single-cell T-cell myélome R python

Description

La plate-forme de génomique GO@L (https://ums-plbs.univ-lille.fr/les-plateformes-constitutives/genomique) et l’équipe de recherche PERSTIM recrutent un ingénieur en bioinformatique pour l’analyse de données de single-cell.

Le projet initial concerne des essais cliniques évaluant des anticorps bispécifiques chez des patients atteints de myélome multiple nouvellement diagnostiqué (IFM2021-01, NCT05572229). L'objectif du projet est d'évaluer le rôle des néoantigènes des cellules T spécifiques et l'évolution immunitaire au cours du traitement.

Vous serez accueilli au sein de plateforme GO@L, entouré de bioinformaticiens travaillant sur des données de single-cell et plus généralement de données de génomique haut débit. Vous aurez accès à un cluster de calcul combinant CPU et GPU. Vous serez également en immersion dans l’équipe de recherche PERSTIM une partie de la semaine pour bien comprendre les enjeux biologiques.

La plateforme GO@L est l’une des 8 plateformes de l’unité PLBS (Plateformes Lilloises en Biologie et Santé) au service des unités de recherche académiques en sciences de la vie et de la santé. Vous bénéficierez d’un environnement innovant et profitrez des échanges avec le personnel des plateformes et de l’équipe de reccherche. Par ce recrutement initial, l’équipe PERSTIM souhaite recruter à long terme un ingénieur en bioinformatique pour l’accompagner dans ses projets de génomique haut débit, notamment de single-cell.

Compétences/Savoir-être :

- Maitrise du langage de programmation R, connaissances de base en langage python

- Connaissance du package Seurat pour l’analyse de données de single-cell

- Présenter les résultats et approches utilisées sous forme de rapports, publications, présentations orales

- Assurer et organiser la veille scientifique et technologique dans le domaine du single-cell

- Goût pour les projets mélant bioinformatique et biologie

- Tenir une conversation orale en anglais

Merci d’envoyer votre candidature (CV+LM) à martin.figeac@univ-lille.fr et salomon.manier@chu-lille.fr avec pour objet « Candidature bioinformaticien GO@L/PRESTIM ».