Mots-Clés

python pipeline PCR

Description

Acteur mondial dans le domaine du diagnostic in vitro depuis plus de 60 ans, bioMérieux propose des solutions de diagnostic qui déterminent l'origine d'une maladie ou d'une contamination pour améliorer la santé des patients et assurer la sécurité des consommateurs.

Rejoignez bioMérieux, c'est choisir une société familiale et humaniste, portée par une vision long terme, au service de la santé publique dans le monde.

Chaque stagiaire ou alternant est accompagné par un tuteur expérimenté et formé. Il ou elle bénéficie d'un suivi et d'une évaluation l'aidant à progresser et à se préparer à la vie professionnelle.

 

La PCR en temps réel (RT-PCR) est une méthode de biologie moléculaire permettant de détecter la présence et de déterminer la quantité d'un pathogène dans un échantillon clinique, alimentaire ou pharmaceutique par l'amplification d'une cible moléculaire.  Dans le cadre du développement et de l'amélioration de ses systèmes, bioMérieux s'appuie sur des outils de simulation numérique, en complément des expériences de laboratoire, entrant dans la classe des jumeaux numériques (« digital twins »).

Pour favoriser la diffusion du simulateur au sein des équipes R&D de bioMérieux et améliorer son intégration à l'écosystème de logiciels servant à la conception et la mise au point de tests de diagnostic in vitro, bioMérieux propose une étape de développement informatique d'une durée de 6 mois.

Quelle est votre mission chez bioMérieux ?

- Comprendre le fonctionnement général du code de simulation (codé en Python) et son environnement logiciel,

- Proposer une ou plusieurs méthodes de gestion des données entrées/sorties du simulateur afin de garantir son intégration dans un « pipeline » d'outils automatisés,

- Mettre en œuvre et valider la méthode choisie en accord avec l'encadrement,

- Proposer et développer une interface homme-machine (IHM) pour favoriser l'accessibilité de l'outil hors d'un contexte automatisé,

- Documenter le travail réalisé et les aspects méthodologiques.  

Qui êtes-vous?

- Vous suivez actuellement une formation de niveau BAC+5 type Master 2 ou cycle ingénieur avec une spécialisation en informatique, génie logiciel, ou domaine similaire,

- Vous avez des compétences avancées en programmation (Python) et une expérience avec la librairie Streamlit,

- Vous avez des bonnes connaissances des bases de données NoSQL, en particulier MongoDB,

- Une première expérience professionnelle dans ce domaine serait un plus,

- La biologie moléculaire et les simulations numériques vous intéressent,

- Vous avez une bonne maîtrise de gestionnaires de version (Gitlab),

- Votre rigueur, votre sens de l'organisation et votre esprit d'équipe; vous permettez de mener avec succès les missions qui vous sont confiées,

- Vous avez un niveau d'anglais courant, vous permettant ainsi d'évoluer dans un environnement international.

 

Ce stage est basé sur le site bioMérieux de Grenoble, pour une durée de 6 mois à partir de Février 2025.

 

La gratification mensuelle pour un stagiaire est obtenue dès un mois de présence.

 

Le montant de la gratification dépend du niveau de formation de l'étudiant et est supérieur au minimum légal.

 

 Les + :

• Restaurant d'entreprise avec participation de l'employeur.

• Remboursement de 100 % de l'abonnement de transports en commun ou indemnité de transport.

• Conciergerie sur les sites de Craponne, Marcy et La Balme.

 

bioMérieux s'engage à éviter toute discrimination et à traiter tous les candidats de manière équitable sans distinction d'origine, de sexe, d'âge, de caractéristiques physiques, d'origine sociale, de handicap, d'appartenance syndicale, de religion, de situation familiale, de grossesse, d'orientation sexuelle, d'identité de genre, d'expression de genre ou de tout autre critère illégal selon la loi applicable.

 

* F/H/D : Femme/Homme/Diversité :   bioMérieux s'engage à promouvoir l'égalité des chances en matière d'emploi.