Mots-Clés

'web scrapping', 'AWS', 'GIT', 'Python'

Description

Résumé du poste

Le poste se situe dans l’équipe du Centre d'Excellence en Pathogènes Respiratoires (CERP, https://ciri.ens-lyon.fr/cerp) basé à Lyon, France. Le CERP développe des recherches pour appuyer la prise de décision liée aux pathogènes respiratoires au sein des Hospices Civils de Lyon et de l'Université Claude Bernard Lyon 1. Le CERP fait partie du Centre International de Recherche en Infectiologie (CIRI).

Les missions du CERP sont :

• de créer l'excellence dans la recherche multidisciplinaire combinant la virologie, l'épidémiologie, l'analyse, la bioinformatique et la modélisation ;
• d’assurer un continuum depuis la collecte de données jusqu’à leur utilisation dans des décisions politiques ;
• d’être un rassembleur pour les principaux acteurs internationaux travaillant sur cette thématique et développer des instruments public-privé pour assurer des synergies.

Le CERP va héberger sur son site Internet un tableau de bord permettant d'afficher la circulation mondiale du virus de la grippe et du virus respiratoire syncytial. Cette plateforme, construite à partir de web scraping, est destinée à un large public, comprenant la population générale, les chercheurs et les décideurs politiques. L’algorithme de web scraping a besoin d’un support régulier pour maintenir à jour la plateforme alimentée en données. Vos tâches consisteront notamment à réaliser la maintenance la plateforme et à effectuer des analyses de données pour des projets de recherche en collaboration avec des experts du CERP. Ces analyses porteront soit sur les données de la plateforme, soit sur d’autres bases de données sur les pathogènes et infections respiratoires. En fonction de vos compétences et de vos aspirations, des missions de data management pourraient être envisagées.

Ce poste sera clé pour développer les activités du CERP autour de l'analyse de données pour soutenir les différentes études et projets. Il s'agit d'une opportunité unique pour un analyste de données de rejoindre une récente équipe de recherche motivée et expérimentée dans un environnement de travail international pour relever les principaux défis de santé liés aux maladies respiratoires. Cet expert travaillera en collaboration sur des études analytiques innovantes de haute qualité et pourra bénéficier de plusieurs grandes bases de données, de plateformes d’études et de partenariats externes avec d’autres partenaires universitaires, gouvernementaux et industriels.

Tâches essentielles

Web scraping

Une de vos missions (environ 1 jour/semaine) comprendra la gestion d'une trentaine de webscrapers, c'est-à-dire des scripts Python qui récupèrent automatiquement les données épidémiologiques des sites web publics. Vous serez responsable de vous assurer que tous les scripts fonctionnent chaque semaine, car les données récupérées seront utilisées par d'autres projets CERP.

Analyse de données

• Analyser des données à l'aide de méthodes statistiques ou de machine learning, par exemple pour identifier les tendances des séries chronologiques ou extraire des variables importantes dans la classification.
• Interpréter les résultats des modèles.
• Générer des rapports (éventuellement des publications scientifiques) et des visualisations de données résumant vos analyses.
• Communiquer les résultats au sein de l'équipe et lors de réunions scientifiques (avec des partenaires externes ou en congrès).
• En fonction de vos compétences et de vos aspirations, le data management d’une base de données volumineuse du CERP est possible.

Compétences techniques

• Expérience en Python, incluant le scraping notamment avec Selenium et BeautifulSoup.
• Système de gestion de versions GIT.
• Amazon Web Services (AWS) : expérience notamment dans l'utilisation de dockers.
• Bonnes pratiques de codage.
• Le logiciel R et la connaissance des solutions de création de sites Web et de tableaux de bord sont un plus.

Formation et expérience professionnelle

• Diplôme d'une école d'ingénieur ou d'un master Bac +5 avec une spécialisation en science des données ou en statistique.
• 2 ans minimum d'expérience en analyse de données.

Compétences

• Anglais écrit courant.

• Approche systématique de la résolution des problèmes, y compris l'identification des causes profondes et des solutions.
• Intégrité, curiosité, proactivité, prudence, esprit d'auto-organisation et orienté vers les solutions.
• Bonne prévoyance, bon jugement et capacité à travailler de manière indépendante.
• Approche enthousiaste et professionnelle du travail avec des collègues et des collaborateurs externes. Capacité à coopérer de manière inter-fonctionnelle et à identifier des solutions multidisciplinaires.