Mots-Clés
metabolomics
R
Statistiques
Linux
omics
Description
**Profil recherché : **
Le stage requiert une volonté de comprendre les rouages biostatistiques des méthodes utilisées en analyses « -Omics ».
**Contexte scientifique : **
Deux protéines sont actuellement candidates pour réduire la perméabilité vasculaire lors d’un infarctus du myocarde ou de l’insuffisance cardiaque. Une étude métabolomique a été réalisée sur des souris contrôles, ayant reçu l’une des deux protéines et sur des souris pathologiques (injection de LPS) ayant reçu l’une des deux protéines. L’objectif est de comprendre les modifications métaboliques de ces protéines et d’identifier des biomarqueurs d’efficacité thérapeutique éventuels.
**Objectifs, travail demandé :
**
• Se familiariser avec les outils mis à disposition : Galaxy et ordinateur sous Linux Ubuntu.
• Se familiariser avec les tests biostatistiques utilisés en analyse « -Omics »
• Analyses de données d’une étude de métabolomiques ciblées
**Compétences requises
Travailler sous environnement Linux
Travailler avec R, R studio, des notions de Python.
Lieu : HU Henri Mondor, 1 rue Gustave Eiffel, 94010 CRETEIL Cedex
Responsables :
Abdel AISSAT, MCU-PH, DMU Biologie Pathologie, IMRB, équipe GEIC20
Anne HULIN, PA-PH, DMU Biologie Pathologie, IMRB, équipe PROTECT