Société Française de Bioinformatique

Mots-Clés

omics ngs r programming statistics

Description

Dans le cadre d’un projet PEPR (Programmes et Equipements Prioritaires de Recherche) visant à comprendre la pathogénèse des virus hémorragiques, le Hub recrute un·e ingénieur·e de recherche en bioinformatique et biostatistique, pour l’analyse des données du projet pour un CDD de 20 mois.

Le projet COPAFLICT a pour objectif d’améliorer les connaissances fondamentales sur les fièvres hémorragiques virales et offrir de nouvelles perspectives pour leur diagnostic et leur traitement. Pour ce faire, il étudiera l’immunopathogénèse associée au virus de la fièvre Lassa (fièvre hémorragique foudroyante), pour identifier les voies immunitaires d’intérêt pour le développement de nouvelles stratégies thérapeutiques ciblant la réponse de l’hôte.

Les 2 missions principales du poste sont :

1. Prendre en charge l’analyse bioinformatique et statistique des données quantitatives issues de séquençage à haut débit (transcriptomiques, protéomiques) et données cliniques générées par les collaborateurs du projet PEPR.
   Dans ce contexte, la personne recrutée sera amenée à :
   • Développer une approche d’analyse reproductible implémentée en R ;
   • Interagir (principalement à distance) directement avec les collaborateurs du projet, basés à Lyon (~ 1 déplacement par an)
   • Rédiger des articles scientifiques à l’issue du projet

2. Collaborer sur des projets d’analyse soumis au Hub de Bioinformatique et Biostatistique.

Ces 2 missions prendront plusieurs formes :
• Conseiller et guider dans l’utilisation de méthodes et outils d’analyse existants ;
• Maintenir une veille bibliographique active et évaluer les outils et méthodes publiés ; Intérêt pour les nouvelles pratiques méthodologiques, nouveaux outils et l’analyse de nouveaux types de données
• Analyser les données des collaborateurs et leur exposer les conclusions ;
• Développer lorsque nécessaire des méthodes et outils d’analyse nouveaux.